Что означает суффикс в названии MGEp200DZ?

Цифра — мощность в кВт, буквы на конце — марка двигателя: DZ это Deutz, MT это MTU. Так по названию сразу видно, что внутри.

Какой двигатель в линейке MGE выбрать?

Для большинства задач — Cummins: по нему проще всего с запчастями и сервисом в Беларуси. Perkins берут за ресурс, Baudouin и MTU — на больших мощностях, Mitsubishi — на ответственных объектах.